本學院設有「資訊安全碩士學位學程」及「資訊安全博士學位學程」。

學程簡介：

本學位學程規劃培育具備「工業物聯網與軟體安全」研發人才之專業知識、培育具備「金融資訊安全管理與稽核」之專業技能等二大重點方向，並依此重點方向規劃發展出本校特色的資訊安全課程，包括建立資訊安全實作練習場域強化學生的資訊安全實作能力、輔導與協助取得資訊安全專業證照、籌組資訊安全學生學習社群。發展重點預計與國家級的資安卓越研究中心合作，其設有網路威脅防禦實驗室，網路數據分析實驗室，以及先進密碼實驗室。在資安人才培訓上，例如面對資通安全管理法所要求的公務機關專責人力，一直有很大的缺口，因此目標包括培育資安研發人才，工控及金融資安人才也在其中，並希望充分與國內民間資安社群HITCON等合作，以培訓菁英國手。

學程教育目標：
實踐資訊安全對社會之影響與責任，培育學生具備資訊安全專業知識與紮實的資安實務技能，以面對資安科技快速變化的挑戰。
資安學位學程「學生基本素養及核心能力」：

1. 具備運用資訊、數學之能力，並能充分溝通與表達。
2. 具備資訊安全領域專業知識與資訊系統之資安研發與分析相關能力。
3. 在資訊領域團隊中，具備合作協調之能力，並能提供資安相關的協助。
4. 具備創新思考、獨立研究、及解決問題之能力。
5. 能分析資訊產業脈動，並能評估資安研發議題之進展。
6. 具備自我學習能力，以面對資安技術與網路、軟體發展的快速變化。
7. 認識資訊安全對於社會的影響，並承擔相關責任。